Điểm nổi bật của Công ty là có tỷ lệ vốn Nhà nước chi phối, do đó Công ty được tạo điều kiện thuận lợi để phát triển hoạt động sửa chữa công trình đường sắt, và có điều kiện để tham gia các dự án lớn, tiếp cận công nghệ kỹ thuật, công nghệ quản lý của các đối tác trong và ngoài nước có liên hệ với Tổng Công ty Đường sắt Việt Nam. Công ty sẽ tiếp tục đảm nhiệm tốt vai trò sửa chữa định kỳ các công trình đường sắt trong định hướng phát triển chung của ngành đường sắt mà Tổng Công ty Đường sắt đã đề ra. Điểm khác biệt của Công ty với các đơn vị khác trong Tổng Công ty là doanh thu từ hoạt động ngoài công ích chiếm tỷ trọng lớn và lợi nhuận thu được từ hoạt động này là chủ yếu trong cơ cấu lợi nhuận của Công ty.
Quá trình hình thành và phát triển:- Công ty Cổ phần Đường sắt Thanh Hóa được thành lập và hoạt động ngay sau khi hòa bình lập lại giai đoạn 1959-1960 với các tên gọi đoạn đường sắt Hà Vinh, đoạn đường sắt Thanh Vinh...
- Năm 1998, Xí nghiệp Quản lý dường sắt Thanh Hóa được thành lập theo Quyết định số 874/1998/QĐ/TCCB-LĐ ngày 17/4/1998 của Bộ trưởng Bộ Giao thông Vận tải.
- Năm 2003, Xí nghiệp Quản lý đường sắt Thanh Hóa đổi tên thành Công ty Quản lý đường sắt Thanh Hóa theo Quyết định số 734/2003/QĐ-GTVT ngày 20/3/2003 của Bộ trưởng Bộ Giao thông Vận tải.
- Năm 2010, Công ty Quản lý đường sắt Thanh Hóa được chuyển đổi thành Công ty TNHH một thành viên Quản lý đường sắt Thanh Hóa theo Quyết định số 706/QĐ-ĐS ngày 29/6/2010 của Hội đồng thành viên Tổng công ty Đường sắt Việt Nam.
- Ngày 30/10/2015, Bộ Giao thông Vận tải dã có Quyết định số 3899/QĐ - BGTVT phê duyệt phương án cổ phần hóa Công ty TNHH MTV Quản lý Đường sắt Thanh Hóa thuộc Tổng Công ty Đường sắt Việt Nam.
- Ngày 08/12/2015, phiên bán đấu giá cổ phần lần đầu ra công chúng của Công ty TNHH MTV Quản lý Đường sắt Thanh Hóa đã được tổ chức tại Công ty cổ phần Chứng khoán Tân Việt. Khối lượng cổ phần bán được: 104.295 cổ phần.
- Ngày 25/12/2015, Công ty đã tổ chức họp Đại hội đồng cổ đông lần thứ nhất để thành lập công ty cổ phần. Ngày 04/01/2016, Công ty đã được Sờ Kế hoạch và Đầu tư Tỉnh Thanh Hóa cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp công ty cổ phần số 2800190392 với vốn điều lệ là 20.859.000.000 đồng.
Ngành nghề kinh doanh:
- Quản lý, khai thác, bảo trì, sửa chữa hệ thống kết cấu hạ tầng đường sắt quốc gia.
- Tố chức ứng phó sự cố, thiên tai, cửu nạn giao thông đường sắt.
- Xây dựng công trình đường sắt và đường bộ.
- Xây dựng nhà các loại.
- Thí nghiệm, kiểm nghiệm vật liệu xây dựng, kiểm tra độ bền cơ học bê tông, kết cấu.
- Xây dựng công trình thủy lợi, công nghiệp, đường dây, trạm biến áp.
- Khám chữa bệnh ban dầu và chuyển tuyến khám chữa bệnh Bảo hiểm y tế khu vục đường sắt Thanh Hóa