Sau hơn một tuần mở phiên tòa xem xét đơn kháng cáo, Tòa Phúc thẩm Tòa án nhân dân Tối cao tại Hà Nội, quyết định giảm án cho bị cáo Nguyễn Thanh Phong 3 năm 6 tháng tù; Trần Việt Nga giảm 3 năm tù; các bị cáo khác trong vụ án cũng được giảm án.
Gần nửa năm sau khi tuyên án sơ thẩm, hai bị cáo Nguyễn Thanh Phong, Trần Việt Nga (đều là cựu Cục trưởng Cục An toàn thực phẩm, Bộ Y tế) cùng cấp dưới tiếp tục hầu tòa để cấp phúc thẩm xem xét lại trách nhiệm hình sự.
Bản án xác định bị cáo đã nhận số tiền đặc biệt lớn và phải chịu trách nhiệm đối với toàn bộ số tiền gần 95 tỷ đồng do các chuyên viên dưới quyền nhận trong quá trình thực thi nhiệm vụ.